Kateteret føres ind gennem endoskopets arbejdskanal og via endoskopet kan du se, hvor du befinder dig. 20 - 50 ml sterilt saltvand injiceres via kateteret dybt ned i lungerne, hvorefter så meget væske som muligt suges op. Den aspirerede væske er prøven, hvor der kan udføres en cytologisk undersøgelse for at vurdere cellefordelingen. Bakterie- og svampepodning kan også udføres på væsken. Resten af væsken absorberes i lungerne.